ウサギに、ふんをトイレでする躾をすることはできるか

これは、残念ながら、「ノー」です。

まれに、ふんもトイレでやってくれる子もいますが、できない子の方が殆どです。
ふんがコンスタントに出ている、というのは、ウサギの腸が順調に動いているということですから、むしろ「体調がいいのね」と喜んであげて下さい。

しつけようとして怒られ、それが嫌でふんを我慢するようになると、むしろそちらの方が危険です。